怎么設置國內的源加快R包下載速度

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R語言在使用 install.packages()安裝package的時候，默認會在官方的源（https://cran.rstudio.com/）搜索R包，然后下載到你的電腦或者服務器上。但是官方的源并不在中國，下載速度往往會受到很大的限制，因此當我們安裝好R之后，第一步就應該是把R的安裝源修改為國內的源（也稱鏡像，Mirror）。

修改 install.packages 的安裝源

如果你使用的是有圖形界面的RGui，選擇 Packages --> Set CRAN mirror --> China (Guangzhou)

如果你使用的是Rstudio，選擇 Tools --> Global options --> Packages

點擊Change，選擇離你所在城市最近的國內源

怎么設置國內的源加快R包下載速度

也可以輸入以下代碼（適合不帶圖形界面的R），直接修改

options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))

通過 getOption("repos") 命令可以知道目前的鏡像網站是哪里的

修改 bioconductor 的安裝源

絕大部分的生物信息相關的R包（如DESeq2, limma, clusterProfiler）都在 bioconductor，并不在官方的源里面，所以通過 install.packages() 命令會找不到對應的R包。得使用如下命令安裝：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))    install.packages("BiocManager")BiocManager::install("DESeq2")

同樣，使用option命令修改bioconductor的源為國內源，就再也不用忍受bioconductor 的龜速了，代碼如下：

options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")

到此，關于“怎么設置國內的源加快R包下載速度”的學習就結束了，希望能夠解決大家的疑惑。理論與實踐的搭配能更好的幫助大家學習，快去試試吧！若想繼續學習更多相關知識，請繼續關注創新互聯網站，小編會繼續努力為大家帶來更多實用的文章！

當前文章：怎么設置國內的源加快R包下載速度
文章URL：http://www.2m8n56k.cn/article14/jdsgde.html

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