這篇文章主要介紹HPRD數(shù)據(jù)庫有什么用，文中介紹的非常詳細(xì)，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們一定要看完！

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HPRD全稱Human Protein Reference Database, 是一個專門存儲人類蛋白質(zhì)相互作用信息的數(shù)據(jù)庫，和其他同類數(shù)據(jù)庫相比，該數(shù)據(jù)庫中存儲的蛋白質(zhì)互作信息都是經(jīng)過實驗驗證的，而且數(shù)量上有明顯優(yōu)勢。該數(shù)據(jù)的網(wǎng)址如下

http://hprd.org/index_html

在文獻(xiàn)中，對HPRD和其他數(shù)據(jù)庫進(jìn)行了比較，結(jié)果如下

圖片A表示不同數(shù)據(jù)庫中存儲的人類蛋白質(zhì)相互作用的數(shù)據(jù)，從柱狀圖上可以明顯看到，HPRD的數(shù)據(jù)量最大，而且冗余的信息很少；圖片B表示不同數(shù)據(jù)庫中蛋白相互作用數(shù)量的分布，從圖中可以看到，每個階段都是HPRD最佳。

除了數(shù)據(jù)質(zhì)量和數(shù)量上的優(yōu)勢，HPRD還提供了蛋白質(zhì)的表達(dá)譜，分類，結(jié)構(gòu)域，亞細(xì)胞定位，轉(zhuǎn)錄后修飾，通路等其他信息，該數(shù)據(jù)庫最新版為release 9, 其中的信息統(tǒng)計如下

通過Query, 可以檢索某個蛋白質(zhì)的相關(guān)信息，示意如下

在檢索結(jié)果頁面，可以看到該蛋白質(zhì)各種注釋信息，示意如下

即包括分子量，序列等基本信息，也包括亞細(xì)胞定位，蛋白結(jié)構(gòu)域，相互作用，GO注釋等信息。

通過Browse功能，可以查看指定類別的蛋白質(zhì)信息，示意如下

可以根據(jù)分子類別，轉(zhuǎn)錄后修飾，亞細(xì)胞定位，結(jié)構(gòu)域等信息進(jìn)行篩選和查看。

該數(shù)據(jù)庫的信息是可以下載的，但是只是學(xué)術(shù)免費， 示意如下

對于蛋白質(zhì)相互作用的信息，提供了Tab和XML兩種格式供下載。

通過該數(shù)據(jù)庫我們可以方便的查詢某個蛋白的相互作用網(wǎng)絡(luò)，但是對于多個蛋白間的相互作用網(wǎng)絡(luò)，只能自己從下載的數(shù)據(jù)文件中處理得到。

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網(wǎng)頁標(biāo)題：HPRD數(shù)據(jù)庫有什么用
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